Pada tahun 2012, setelah peristiwa Digimon Adventure: Last Evolution Kizuna, DigiDestined dewasa awal—Daisuke, Miyako, Iori, Takeru Takashi, Hikari, dan Ken—harus mendamaikan tanggung jawab baru mereka dengan mitra Digimon mereka. Namun Rui Owada, seorang pemuda misterius, muncul, mengaku sebagai manusia pertama yang bermitra dengan Digimon–Ukkomon. Mungkinkah Rui benar-benar menjadi DigiDestined yang pertama?